Исследователи — муж и жена Флориан — остались со своими дочерьми Амитией и Кирие на умирающей планете Элтория в надежде найти способ возродить её. Однако этой мечте, похоже, не суждено было сбыться, так как отец семейства Гранц Флориан заболел. Вопреки воле своей старшей сестры, Кирие отправляется за помощью в далёкий альтернативный мир вместе со своей подругой детства Ирис. Они прибывают на Землю в Японию, чтобы найти ключ к возрождению своей планеты. На Земле они встречаются с Нанохой, Фейт и Хаятэ.
Последовательность просмотра аниме:
Сердечный треугольник - OVA, 2000 год
Лиричная волшебница Наноха: Коробка с игрушкой - Клип, 2001 год